Năm học 2024-2025, nhà trường đã hoàn thành xuất sắc nhiệm vụ được giao với 100% HS lớp 12 đậu tốt nghiệp, 38 giải HSG lớp 12 cấp Thành phố với 3 giải Nhất, 17 giải HSG lớp 12 Giải toán trên MTCT cấp Thành phố, 61 giải Cuộc thi Olympic tháng 4 TP.HCM với 10 giải Nhất, 6 giải cuộc thi Khoa học kỹ thuật cấp Thành phố, ngoài ra trường còn đạt nhiều thành tích trong Hội thi tin học trẻ Thành phố, các giải Thể thao học sinh Thành phố, 100% CB-GV-NV đạt Lao động tiên tiến, trong đó có 23 CB-GV-NV được đề nghị danh hiệu Chiến sĩ thi đua cấp cơ sở và 04 CB-GV-NV được đề nghị danh hiệu Chiến sĩ thi đua cấp Thành phố. Các tổ chức đoàn thể trong nhà trường đều đạt thành tích cao trong công tác và được khen thưởng các cấp. Công tác xã hội hóa giáo dục, công tác xã hội và nghiên cứu khoa học (sáng kiến) được quan tâm và đầu tư và đáp ứng được yêu cầu giáo dục trong giai đoạn hiện nay. Đặc biệt trong năm học vừa qua, trường vinh dự nhận Cờ thi đua của Chính phủ vì có thành tích xuất sắc, dẫn đầu phong trào thi đua yêu nước của Thành phố Hồ Chí Minh.
Với những thành quả trên, Trong Hội nghị tổng kết năm học 2024-2025 và triển khai nhiệm vụ năm học 2025-2026 đối với Giáo dục Trung học, trường THPT Trần Khai Nguyên đã vinh dự nhận Giấy khen của Sở GD&ĐT TP.HCM vì Đã có thành tích xuất sắc trong thực hiện nhiệm vụ Giáo dục phổ thông năm học 2024-2025.
Hy vọng với sự nỗ lực của đội ngũ cán bộ, giáo viên, nhân viên và học sinh, tin rằng trường THPT Trần Khai Nguyên tiếp tục “gặt hái” nhiều “quả ngọt” trong năm học 2025-2026, đây cũng là thành quả đáng tự hào trong dịp kỷ niệm 50 năm thành lập trường THPT Trần Khai Nguyên.